金线莲常见的病虫害有以下几种：
猝倒病：由镰刀菌引起，主要危害金线莲的茎基部，导致病苗迅速倒伏死亡。
软腐病：属细菌性病害，主要为害金线莲中下部内茎和近地表叶片的叶柄，严重时会导致全株蔫枯。
炭疽病：可在任何时候发生，在夏季高温与阴雨天气较容易发生，发病初期叶子会出现褐色斑点，后期会变成黑色。
白绢病：在梅雨季节容易发生，发病初期叶子基部会被白色菌丝覆盖，随后根茎会腐烂。
介壳虫：也被叫做兰虱，在空气流通较差、温度较高、湿度较大的环境中容易发生，繁殖速度快，会啃食金线莲的叶片。
蜗牛和蛞蝓：喜欢吃金线莲的幼嫩组织，会导致金线莲生长不良。
红蜘蛛及螨类：以成虫和若虫在叶片上吸取汁液，使叶片出现黄色小点，严重时会导致叶片枯黄。
小地老虎：3龄后幼虫会将金线莲幼苗从近地面的嫩茎咬断，造成缺苗断垄。
蝼蛄：在土中咬食幼苗根茎，会使幼苗死亡。