福建金线莲和台湾金线莲主要有以下区别：
一、外观特征
叶片形状：
福建金线莲：叶片多为狭长形，呈椭圆形或卵形，叶尖较尖。
台湾金线莲：叶子通常呈桃心形，较为圆润，叶片较厚且小，直径为 1 - 3 厘米。
叶脉颜色：
福建金线莲：叶脉金黄色，颜色较为鲜艳，脉络清晰。
台湾金线莲：叶面鲜绿色，嵌有银白色网脉，脉纹清晰稀疏。
茎秆：
福建金线莲：茎秆相对较细。
台湾金线莲：茎秆粗。
二、生长环境
自然分布：
福建金线莲：主要分布在福建的山区，如武夷山等地，多生长在海拔较高的林地溪沟边阴凉处，近阔叶林或针阔叶林交混地带。
台湾金线莲：自然分布于台湾地区的低海拔山区，如阳明山等地，喜欢生长在潮湿、阴凉且有一定遮荫的环境中。
适应环境：
福建金线莲：对环境的适应能力相对较强，在一定程度上能够适应福建地区的气候和土壤条件。但由于野生资源的减少，现在也多为人工种植，需要模拟其适宜的生长环境，如控制温度、湿度和光照等。
台湾金线莲：对生长环境要求较为苛刻，需要较高的空气湿度和特定的土壤条件。在台湾地区，由于气候和地理环境的特殊性，其生长环境相对较为稳定。
三、药用价值
成分含量：
福建金线莲：含有多种药用成分，如黄酮类、生物碱、多糖等。其中，黄酮类成分具有抗氧化、抗炎等作用；生物碱对人体的神经系统和心血管系统有一定的调节作用；多糖则具有免疫调节、抗肿瘤等功效。不同产地和生长环境的福建金线莲，其成分含量会有所差异。
台湾金线莲：也富含多种活性成分，在成分含量上与福建金线莲有一定的相似性，但也存在一些差异。例如，台湾金线莲中的某些成分具有独特的药理作用。
功效特点：
福建金线莲：具有清热凉血、除湿解毒、平衡阴阳、扶正固本等功效，可用于治疗肺热咳嗽、肺结核咯血、尿血、小儿惊风、肾炎、膀胱炎、糖尿病、血尿等病症。
台湾金线莲：在药用功效方面与福建金线莲类似，但在一些方面具有独特的疗效。例如，在调节人体免疫系统、抗衰老等方面有一定的优势。
四、市场价值
价格：
福建金线莲：由于产量相对较大，且人工种植技术较为成熟，价格相对较为亲民。但野生福建金线莲由于资源稀少，价格较高。
台湾金线莲：由于生长环境的特殊性和产量相对较少，市场价格通常较高。尤其是野生台湾金线莲，更是价格昂贵。
市场认可度：
福建金线莲：在国内市场上具有较高的知名度和认可度，被广泛应用于中药材和保健品领域。随着人工种植技术的不断提高，其市场份额逐渐扩大。
台湾金线莲：在台湾地区和一些国际市场上受到较高的关注和认可。由于其独特的品质和功效，在高端保健品和中药材市场上具有一定的竞争力。